Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
GATA6Q92908 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
GATA6Q92908 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GATA6Q92908 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GATA6Q92908 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GATA6Q92908 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GATA6Q92908 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GATA6Q92908 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GATA6Q92908 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GATA6Q92908 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GATA6Q92908 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GATA6Q92908 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GATA6Q92908 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GATA6Q92908 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GATA6Q92908 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GATA6Q92908 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GATA6Q92908 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GATA6Q92908 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GATA6Q92908 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GATA6Q92908 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GATA6Q92908 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GATA6Q92908 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GATA6Q92908 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GATA6Q92908 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GATA6Q92908 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GATA6Q92908 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GATA6Q92908 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GATA6Q92908 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GATA6Q92908 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GATA6Q92908 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GATA6Q92908 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GATA6Q92908 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GATA6Q92908 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GATA6Q92908 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GATA6Q92908 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GATA6Q92908 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GATA6Q92908 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GATA6Q92908 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GATA6Q92908 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GATA6Q92908 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GATA6Q92908 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GATA6Q92908 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GATA6Q92908 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GATA6Q92908 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms