Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTW3

COG1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG1Q8WTW3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG1Q8WTW3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG1Q8WTW3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG1Q8WTW3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG1Q8WTW3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG1Q8WTW3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG1Q8WTW3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG1Q8WTW3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG1Q8WTW3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG1Q8WTW3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COG1Q8WTW3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COG1Q8WTW3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COG1Q8WTW3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COG1Q8WTW3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COG1Q8WTW3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
COG1Q8WTW3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COG1Q8WTW3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
COG1Q8WTW3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COG1Q8WTW3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COG1Q8WTW3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COG1Q8WTW3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COG1Q8WTW3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COG1Q8WTW3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COG1Q8WTW3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COG1Q8WTW3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COG1Q8WTW3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COG1Q8WTW3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COG1Q8WTW3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COG1Q8WTW3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COG1Q8WTW3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COG1Q8WTW3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
COG1Q8WTW3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COG1Q8WTW3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COG1Q8WTW3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COG1Q8WTW3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COG1Q8WTW3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COG1Q8WTW3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COG1Q8WTW3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COG1Q8WTW3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COG1Q8WTW3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COG1Q8WTW3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COG1Q8WTW3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COG1Q8WTW3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COG1Q8WTW3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COG1Q8WTW3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COG1Q8WTW3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COG1Q8WTW3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
COG1Q8WTW3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
COG1Q8WTW3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COG1Q8WTW3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COG1Q8WTW3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
COG1Q8WTW3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
COG1Q8WTW3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COG1Q8WTW3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COG1Q8WTW3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COG1Q8WTW3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COG1Q8WTW3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COG1Q8WTW3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COG1Q8WTW3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COG1Q8WTW3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG1Q8WTW3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG1Q8WTW3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG1Q8WTW3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG1Q8WTW3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG1Q8WTW3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG1Q8WTW3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG1Q8WTW3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
COG1Q8WTW3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG1Q8WTW3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG1Q8WTW3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG1Q8WTW3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG1Q8WTW3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG1Q8WTW3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG1Q8WTW3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG1Q8WTW3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG1Q8WTW3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG1Q8WTW3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG1Q8WTW3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG1Q8WTW3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG1Q8WTW3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG1Q8WTW3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG1Q8WTW3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG1Q8WTW3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
COG1Q8WTW3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
COG1Q8WTW3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG1Q8WTW3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG1Q8WTW3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG1Q8WTW3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG1Q8WTW3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG1Q8WTW3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COG1Q8WTW3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COG1Q8WTW3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COG1Q8WTW3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COG1Q8WTW3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COG1Q8WTW3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COG1Q8WTW3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COG1Q8WTW3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COG1Q8WTW3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms