Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHU2

CFAP61, Cilia- and flagella-associated protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP61Q8NHU2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP61Q8NHU2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP61Q8NHU2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP61Q8NHU2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP61Q8NHU2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP61Q8NHU2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP61Q8NHU2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP61Q8NHU2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP61Q8NHU2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP61Q8NHU2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP61Q8NHU2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP61Q8NHU2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP61Q8NHU2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP61Q8NHU2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP61Q8NHU2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP61Q8NHU2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP61Q8NHU2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms