Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEC5

CATSPER1, Cation channel sperm-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER1Q8NEC5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CATSPER1Q8NEC5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms