Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCX0

CCDC150, Coiled-coil domain-containing protein 150, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC150Q8NCX0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC150Q8NCX0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC150Q8NCX0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC150Q8NCX0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC150Q8NCX0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC150Q8NCX0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC150Q8NCX0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC150Q8NCX0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC150Q8NCX0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC150Q8NCX0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC150Q8NCX0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC150Q8NCX0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC150Q8NCX0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC150Q8NCX0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC150Q8NCX0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC150Q8NCX0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC150Q8NCX0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC150Q8NCX0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC150Q8NCX0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC150Q8NCX0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC150Q8NCX0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC150Q8NCX0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC150Q8NCX0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC150Q8NCX0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC150Q8NCX0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC150Q8NCX0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC150Q8NCX0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC150Q8NCX0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC150Q8NCX0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC150Q8NCX0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC150Q8NCX0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC150Q8NCX0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC150Q8NCX0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC150Q8NCX0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC150Q8NCX0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC150Q8NCX0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC150Q8NCX0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC150Q8NCX0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC150Q8NCX0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC150Q8NCX0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC150Q8NCX0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC150Q8NCX0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC150Q8NCX0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC150Q8NCX0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC150Q8NCX0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC150Q8NCX0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC150Q8NCX0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC150Q8NCX0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC150Q8NCX0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC150Q8NCX0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC150Q8NCX0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC150Q8NCX0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC150Q8NCX0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC150Q8NCX0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC150Q8NCX0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC150Q8NCX0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC150Q8NCX0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC150Q8NCX0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC150Q8NCX0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC150Q8NCX0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC150Q8NCX0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC150Q8NCX0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC150Q8NCX0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC150Q8NCX0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC150Q8NCX0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC150Q8NCX0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC150Q8NCX0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC150Q8NCX0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC150Q8NCX0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC150Q8NCX0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC150Q8NCX0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC150Q8NCX0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC150Q8NCX0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC150Q8NCX0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC150Q8NCX0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC150Q8NCX0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC150Q8NCX0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC150Q8NCX0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC150Q8NCX0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC150Q8NCX0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC150Q8NCX0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC150Q8NCX0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC150Q8NCX0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC150Q8NCX0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC150Q8NCX0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC150Q8NCX0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC150Q8NCX0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC150Q8NCX0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC150Q8NCX0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC150Q8NCX0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC150Q8NCX0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC150Q8NCX0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC150Q8NCX0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC150Q8NCX0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC150Q8NCX0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC150Q8NCX0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC150Q8NCX0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC150Q8NCX0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC150Q8NCX0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC150Q8NCX0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.8 ms