Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC54

KCT2, Keratinocyte-associated transmembrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCT2Q8NC54 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCT2Q8NC54 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCT2Q8NC54 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCT2Q8NC54 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCT2Q8NC54 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCT2Q8NC54 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCT2Q8NC54 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCT2Q8NC54 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCT2Q8NC54 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCT2Q8NC54 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCT2Q8NC54 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCT2Q8NC54 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCT2Q8NC54 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCT2Q8NC54 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCT2Q8NC54 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCT2Q8NC54 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCT2Q8NC54 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCT2Q8NC54 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCT2Q8NC54 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCT2Q8NC54 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCT2Q8NC54 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCT2Q8NC54 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCT2Q8NC54 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCT2Q8NC54 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCT2Q8NC54 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCT2Q8NC54 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCT2Q8NC54 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCT2Q8NC54 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCT2Q8NC54 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCT2Q8NC54 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCT2Q8NC54 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCT2Q8NC54 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCT2Q8NC54 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KCT2Q8NC54 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCT2Q8NC54 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCT2Q8NC54 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCT2Q8NC54 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KCT2Q8NC54 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCT2Q8NC54 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCT2Q8NC54 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCT2Q8NC54 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCT2Q8NC54 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCT2Q8NC54 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCT2Q8NC54 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCT2Q8NC54 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms