Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9R8

SCAI, Protein SCAI, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAIQ8N9R8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SCAIQ8N9R8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCAIQ8N9R8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCAIQ8N9R8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCAIQ8N9R8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAIQ8N9R8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAIQ8N9R8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAIQ8N9R8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAIQ8N9R8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAIQ8N9R8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAIQ8N9R8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAIQ8N9R8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAIQ8N9R8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAIQ8N9R8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAIQ8N9R8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAIQ8N9R8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAIQ8N9R8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAIQ8N9R8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAIQ8N9R8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAIQ8N9R8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAIQ8N9R8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAIQ8N9R8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAIQ8N9R8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAIQ8N9R8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAIQ8N9R8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAIQ8N9R8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAIQ8N9R8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAIQ8N9R8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAIQ8N9R8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAIQ8N9R8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAIQ8N9R8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAIQ8N9R8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAIQ8N9R8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAIQ8N9R8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAIQ8N9R8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAIQ8N9R8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAIQ8N9R8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAIQ8N9R8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAIQ8N9R8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms