Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6M0

OTUD6B, OTU domain-containing protein 6B, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD6BQ8N6M0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTUD6BQ8N6M0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms