Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4L8

CCDC24, Coiled-coil domain-containing protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC24Q8N4L8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC24Q8N4L8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC24Q8N4L8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC24Q8N4L8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC24Q8N4L8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC24Q8N4L8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC24Q8N4L8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC24Q8N4L8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC24Q8N4L8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC24Q8N4L8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC24Q8N4L8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC24Q8N4L8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC24Q8N4L8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC24Q8N4L8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC24Q8N4L8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC24Q8N4L8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC24Q8N4L8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC24Q8N4L8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC24Q8N4L8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC24Q8N4L8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC24Q8N4L8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC24Q8N4L8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC24Q8N4L8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC24Q8N4L8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC24Q8N4L8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC24Q8N4L8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC24Q8N4L8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC24Q8N4L8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC24Q8N4L8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC24Q8N4L8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC24Q8N4L8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC24Q8N4L8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC24Q8N4L8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC24Q8N4L8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC24Q8N4L8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC24Q8N4L8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC24Q8N4L8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC24Q8N4L8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC24Q8N4L8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC24Q8N4L8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC24Q8N4L8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC24Q8N4L8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC24Q8N4L8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC24Q8N4L8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC24Q8N4L8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC24Q8N4L8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC24Q8N4L8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC24Q8N4L8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC24Q8N4L8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC24Q8N4L8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CCDC24Q8N4L8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC24Q8N4L8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC24Q8N4L8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC24Q8N4L8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC24Q8N4L8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC24Q8N4L8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC24Q8N4L8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC24Q8N4L8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC24Q8N4L8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC24Q8N4L8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC24Q8N4L8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC24Q8N4L8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC24Q8N4L8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC24Q8N4L8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC24Q8N4L8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC24Q8N4L8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC24Q8N4L8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC24Q8N4L8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC24Q8N4L8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC24Q8N4L8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC24Q8N4L8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC24Q8N4L8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC24Q8N4L8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC24Q8N4L8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC24Q8N4L8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC24Q8N4L8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC24Q8N4L8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC24Q8N4L8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC24Q8N4L8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC24Q8N4L8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC24Q8N4L8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC24Q8N4L8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC24Q8N4L8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC24Q8N4L8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC24Q8N4L8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC24Q8N4L8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC24Q8N4L8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC24Q8N4L8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC24Q8N4L8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC24Q8N4L8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC24Q8N4L8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC24Q8N4L8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC24Q8N4L8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC24Q8N4L8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC24Q8N4L8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC24Q8N4L8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC24Q8N4L8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC24Q8N4L8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC24Q8N4L8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC24Q8N4L8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms