Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLIP4Q8N3C7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLIP4Q8N3C7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLIP4Q8N3C7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLIP4Q8N3C7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLIP4Q8N3C7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLIP4Q8N3C7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLIP4Q8N3C7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLIP4Q8N3C7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLIP4Q8N3C7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLIP4Q8N3C7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLIP4Q8N3C7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIP4Q8N3C7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIP4Q8N3C7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIP4Q8N3C7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIP4Q8N3C7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIP4Q8N3C7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIP4Q8N3C7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIP4Q8N3C7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIP4Q8N3C7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIP4Q8N3C7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIP4Q8N3C7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLIP4Q8N3C7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLIP4Q8N3C7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLIP4Q8N3C7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLIP4Q8N3C7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLIP4Q8N3C7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLIP4Q8N3C7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLIP4Q8N3C7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLIP4Q8N3C7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLIP4Q8N3C7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLIP4Q8N3C7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLIP4Q8N3C7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CLIP4Q8N3C7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CLIP4Q8N3C7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLIP4Q8N3C7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLIP4Q8N3C7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLIP4Q8N3C7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLIP4Q8N3C7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLIP4Q8N3C7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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