Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms