Protein–RNA interactions for Protein: Q8N118

CYP4X1, Cytochrome P450 4X1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4X1Q8N118 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP4X1Q8N118 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP4X1Q8N118 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP4X1Q8N118 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP4X1Q8N118 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP4X1Q8N118 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP4X1Q8N118 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP4X1Q8N118 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP4X1Q8N118 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP4X1Q8N118 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP4X1Q8N118 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP4X1Q8N118 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP4X1Q8N118 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP4X1Q8N118 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP4X1Q8N118 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP4X1Q8N118 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP4X1Q8N118 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP4X1Q8N118 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP4X1Q8N118 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CYP4X1Q8N118 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CYP4X1Q8N118 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CYP4X1Q8N118 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CYP4X1Q8N118 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CYP4X1Q8N118 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP4X1Q8N118 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP4X1Q8N118 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP4X1Q8N118 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP4X1Q8N118 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP4X1Q8N118 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP4X1Q8N118 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP4X1Q8N118 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYP4X1Q8N118 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYP4X1Q8N118 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CYP4X1Q8N118 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYP4X1Q8N118 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYP4X1Q8N118 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CYP4X1Q8N118 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYP4X1Q8N118 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYP4X1Q8N118 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYP4X1Q8N118 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYP4X1Q8N118 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYP4X1Q8N118 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYP4X1Q8N118 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYP4X1Q8N118 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYP4X1Q8N118 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYP4X1Q8N118 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYP4X1Q8N118 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYP4X1Q8N118 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYP4X1Q8N118 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP4X1Q8N118 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms