Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZS8

CACNA2D3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3Q8IZS8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA2D3Q8IZS8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA2D3Q8IZS8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA2D3Q8IZS8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNA2D3Q8IZS8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms