Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT4

SSX8, Protein SSX8, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX8Q7RTT4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX8Q7RTT4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX8Q7RTT4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX8Q7RTT4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX8Q7RTT4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX8Q7RTT4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX8Q7RTT4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX8Q7RTT4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX8Q7RTT4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX8Q7RTT4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX8Q7RTT4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX8Q7RTT4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX8Q7RTT4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX8Q7RTT4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX8Q7RTT4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX8Q7RTT4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX8Q7RTT4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX8Q7RTT4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX8Q7RTT4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX8Q7RTT4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX8Q7RTT4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX8Q7RTT4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX8Q7RTT4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX8Q7RTT4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX8Q7RTT4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX8Q7RTT4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX8Q7RTT4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX8Q7RTT4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX8Q7RTT4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX8Q7RTT4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX8Q7RTT4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX8Q7RTT4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX8Q7RTT4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX8Q7RTT4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX8Q7RTT4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX8Q7RTT4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX8Q7RTT4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX8Q7RTT4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX8Q7RTT4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX8Q7RTT4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX8Q7RTT4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX8Q7RTT4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX8Q7RTT4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX8Q7RTT4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX8Q7RTT4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX8Q7RTT4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX8Q7RTT4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX8Q7RTT4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX8Q7RTT4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX8Q7RTT4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX8Q7RTT4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SSX8Q7RTT4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSX8Q7RTT4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSX8Q7RTT4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms