Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRC3Q7RTR2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms