Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
OTOP1Q7RTM1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
OTOP1Q7RTM1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
OTOP1Q7RTM1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
OTOP1Q7RTM1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
OTOP1Q7RTM1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
OTOP1Q7RTM1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
OTOP1Q7RTM1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
OTOP1Q7RTM1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
OTOP1Q7RTM1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
OTOP1Q7RTM1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
OTOP1Q7RTM1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
OTOP1Q7RTM1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
OTOP1Q7RTM1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
OTOP1Q7RTM1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
OTOP1Q7RTM1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
OTOP1Q7RTM1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
OTOP1Q7RTM1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
OTOP1Q7RTM1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
OTOP1Q7RTM1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
OTOP1Q7RTM1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
OTOP1Q7RTM1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
OTOP1Q7RTM1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
OTOP1Q7RTM1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
OTOP1Q7RTM1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
OTOP1Q7RTM1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
OTOP1Q7RTM1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
OTOP1Q7RTM1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
OTOP1Q7RTM1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
OTOP1Q7RTM1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
OTOP1Q7RTM1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
OTOP1Q7RTM1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
OTOP1Q7RTM1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
OTOP1Q7RTM1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
OTOP1Q7RTM1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
OTOP1Q7RTM1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
OTOP1Q7RTM1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
OTOP1Q7RTM1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
OTOP1Q7RTM1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
OTOP1Q7RTM1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
OTOP1Q7RTM1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
OTOP1Q7RTM1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
OTOP1Q7RTM1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
OTOP1Q7RTM1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
OTOP1Q7RTM1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
OTOP1Q7RTM1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
OTOP1Q7RTM1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
OTOP1Q7RTM1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
OTOP1Q7RTM1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
OTOP1Q7RTM1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
OTOP1Q7RTM1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
OTOP1Q7RTM1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
OTOP1Q7RTM1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
OTOP1Q7RTM1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
OTOP1Q7RTM1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
OTOP1Q7RTM1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
OTOP1Q7RTM1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
OTOP1Q7RTM1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
OTOP1Q7RTM1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
OTOP1Q7RTM1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
OTOP1Q7RTM1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
OTOP1Q7RTM1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
OTOP1Q7RTM1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
OTOP1Q7RTM1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
OTOP1Q7RTM1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
OTOP1Q7RTM1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
OTOP1Q7RTM1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
OTOP1Q7RTM1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
OTOP1Q7RTM1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
OTOP1Q7RTM1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
OTOP1Q7RTM1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
OTOP1Q7RTM1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
OTOP1Q7RTM1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
OTOP1Q7RTM1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
OTOP1Q7RTM1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
OTOP1Q7RTM1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
OTOP1Q7RTM1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
OTOP1Q7RTM1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
OTOP1Q7RTM1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
OTOP1Q7RTM1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
OTOP1Q7RTM1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
OTOP1Q7RTM1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
OTOP1Q7RTM1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
OTOP1Q7RTM1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
OTOP1Q7RTM1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
OTOP1Q7RTM1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
OTOP1Q7RTM1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
OTOP1Q7RTM1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
OTOP1Q7RTM1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
OTOP1Q7RTM1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
OTOP1Q7RTM1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
OTOP1Q7RTM1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
OTOP1Q7RTM1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
OTOP1Q7RTM1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
OTOP1Q7RTM1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
OTOP1Q7RTM1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
OTOP1Q7RTM1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
OTOP1Q7RTM1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
OTOP1Q7RTM1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
OTOP1Q7RTM1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms