Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSA7

LRRC55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC55Q6ZSA7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC55Q6ZSA7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LRRC55Q6ZSA7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LRRC55Q6ZSA7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LRRC55Q6ZSA7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC55Q6ZSA7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC55Q6ZSA7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC55Q6ZSA7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC55Q6ZSA7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC55Q6ZSA7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC55Q6ZSA7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC55Q6ZSA7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC55Q6ZSA7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC55Q6ZSA7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC55Q6ZSA7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC55Q6ZSA7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC55Q6ZSA7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC55Q6ZSA7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC55Q6ZSA7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC55Q6ZSA7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC55Q6ZSA7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC55Q6ZSA7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC55Q6ZSA7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC55Q6ZSA7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC55Q6ZSA7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC55Q6ZSA7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC55Q6ZSA7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC55Q6ZSA7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC55Q6ZSA7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC55Q6ZSA7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC55Q6ZSA7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC55Q6ZSA7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC55Q6ZSA7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC55Q6ZSA7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC55Q6ZSA7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC55Q6ZSA7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC55Q6ZSA7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC55Q6ZSA7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC55Q6ZSA7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC55Q6ZSA7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC55Q6ZSA7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC55Q6ZSA7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC55Q6ZSA7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC55Q6ZSA7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC55Q6ZSA7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC55Q6ZSA7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC55Q6ZSA7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC55Q6ZSA7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC55Q6ZSA7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms