Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNI0

GCNT7, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 7, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT7Q6ZNI0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCNT7Q6ZNI0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GCNT7Q6ZNI0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCNT7Q6ZNI0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCNT7Q6ZNI0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCNT7Q6ZNI0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCNT7Q6ZNI0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCNT7Q6ZNI0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCNT7Q6ZNI0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCNT7Q6ZNI0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GCNT7Q6ZNI0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCNT7Q6ZNI0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCNT7Q6ZNI0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCNT7Q6ZNI0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCNT7Q6ZNI0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCNT7Q6ZNI0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCNT7Q6ZNI0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GCNT7Q6ZNI0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCNT7Q6ZNI0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNT7Q6ZNI0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNT7Q6ZNI0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNT7Q6ZNI0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNT7Q6ZNI0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNT7Q6ZNI0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNT7Q6ZNI0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNT7Q6ZNI0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNT7Q6ZNI0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNT7Q6ZNI0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNT7Q6ZNI0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNT7Q6ZNI0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNT7Q6ZNI0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCNT7Q6ZNI0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCNT7Q6ZNI0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCNT7Q6ZNI0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCNT7Q6ZNI0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCNT7Q6ZNI0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCNT7Q6ZNI0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCNT7Q6ZNI0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCNT7Q6ZNI0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCNT7Q6ZNI0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCNT7Q6ZNI0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCNT7Q6ZNI0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCNT7Q6ZNI0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCNT7Q6ZNI0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCNT7Q6ZNI0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCNT7Q6ZNI0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCNT7Q6ZNI0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms