Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms