Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TMCO3Q6UWJ1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMCO3Q6UWJ1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMCO3Q6UWJ1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMCO3Q6UWJ1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMCO3Q6UWJ1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMCO3Q6UWJ1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMCO3Q6UWJ1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TMCO3Q6UWJ1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMCO3Q6UWJ1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMCO3Q6UWJ1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMCO3Q6UWJ1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TMCO3Q6UWJ1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMCO3Q6UWJ1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMCO3Q6UWJ1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMCO3Q6UWJ1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMCO3Q6UWJ1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMCO3Q6UWJ1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMCO3Q6UWJ1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMCO3Q6UWJ1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMCO3Q6UWJ1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMCO3Q6UWJ1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TMCO3Q6UWJ1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMCO3Q6UWJ1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMCO3Q6UWJ1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMCO3Q6UWJ1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMCO3Q6UWJ1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMCO3Q6UWJ1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TMCO3Q6UWJ1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMCO3Q6UWJ1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMCO3Q6UWJ1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMCO3Q6UWJ1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMCO3Q6UWJ1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMCO3Q6UWJ1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMCO3Q6UWJ1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMCO3Q6UWJ1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMCO3Q6UWJ1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMCO3Q6UWJ1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMCO3Q6UWJ1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMCO3Q6UWJ1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMCO3Q6UWJ1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMCO3Q6UWJ1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMCO3Q6UWJ1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMCO3Q6UWJ1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMCO3Q6UWJ1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TMCO3Q6UWJ1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMCO3Q6UWJ1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMCO3Q6UWJ1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMCO3Q6UWJ1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMCO3Q6UWJ1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMCO3Q6UWJ1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMCO3Q6UWJ1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMCO3Q6UWJ1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMCO3Q6UWJ1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMCO3Q6UWJ1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMCO3Q6UWJ1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMCO3Q6UWJ1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMCO3Q6UWJ1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TMCO3Q6UWJ1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMCO3Q6UWJ1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMCO3Q6UWJ1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMCO3Q6UWJ1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMCO3Q6UWJ1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMCO3Q6UWJ1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMCO3Q6UWJ1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMCO3Q6UWJ1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMCO3Q6UWJ1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMCO3Q6UWJ1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMCO3Q6UWJ1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMCO3Q6UWJ1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMCO3Q6UWJ1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMCO3Q6UWJ1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMCO3Q6UWJ1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMCO3Q6UWJ1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMCO3Q6UWJ1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMCO3Q6UWJ1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMCO3Q6UWJ1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMCO3Q6UWJ1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMCO3Q6UWJ1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMCO3Q6UWJ1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMCO3Q6UWJ1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMCO3Q6UWJ1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMCO3Q6UWJ1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMCO3Q6UWJ1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMCO3Q6UWJ1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMCO3Q6UWJ1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMCO3Q6UWJ1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMCO3Q6UWJ1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMCO3Q6UWJ1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMCO3Q6UWJ1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMCO3Q6UWJ1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMCO3Q6UWJ1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMCO3Q6UWJ1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMCO3Q6UWJ1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMCO3Q6UWJ1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMCO3Q6UWJ1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMCO3Q6UWJ1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMCO3Q6UWJ1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TMCO3Q6UWJ1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMCO3Q6UWJ1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms