Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATRAIDQ6UW56 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATRAIDQ6UW56 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATRAIDQ6UW56 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATRAIDQ6UW56 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATRAIDQ6UW56 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATRAIDQ6UW56 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATRAIDQ6UW56 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATRAIDQ6UW56 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATRAIDQ6UW56 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATRAIDQ6UW56 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATRAIDQ6UW56 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATRAIDQ6UW56 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATRAIDQ6UW56 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATRAIDQ6UW56 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATRAIDQ6UW56 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATRAIDQ6UW56 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATRAIDQ6UW56 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATRAIDQ6UW56 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATRAIDQ6UW56 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms