Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CASC1Q6TDU7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CASC1Q6TDU7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CASC1Q6TDU7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CASC1Q6TDU7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CASC1Q6TDU7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CASC1Q6TDU7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CASC1Q6TDU7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CASC1Q6TDU7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CASC1Q6TDU7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CASC1Q6TDU7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CASC1Q6TDU7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CASC1Q6TDU7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CASC1Q6TDU7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CASC1Q6TDU7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CASC1Q6TDU7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CASC1Q6TDU7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CASC1Q6TDU7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CASC1Q6TDU7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CASC1Q6TDU7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CASC1Q6TDU7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CASC1Q6TDU7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CASC1Q6TDU7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CASC1Q6TDU7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CASC1Q6TDU7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CASC1Q6TDU7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CASC1Q6TDU7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CASC1Q6TDU7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CASC1Q6TDU7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CASC1Q6TDU7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CASC1Q6TDU7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CASC1Q6TDU7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CASC1Q6TDU7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CASC1Q6TDU7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CASC1Q6TDU7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CASC1Q6TDU7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CASC1Q6TDU7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CASC1Q6TDU7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CASC1Q6TDU7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CASC1Q6TDU7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CASC1Q6TDU7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CASC1Q6TDU7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CASC1Q6TDU7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CASC1Q6TDU7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CASC1Q6TDU7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CASC1Q6TDU7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CASC1Q6TDU7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CASC1Q6TDU7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms