Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCSAPQ6IQ19 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCSAPQ6IQ19 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCSAPQ6IQ19 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCSAPQ6IQ19 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCSAPQ6IQ19 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCSAPQ6IQ19 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCSAPQ6IQ19 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCSAPQ6IQ19 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCSAPQ6IQ19 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCSAPQ6IQ19 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCSAPQ6IQ19 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCSAPQ6IQ19 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCSAPQ6IQ19 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCSAPQ6IQ19 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCSAPQ6IQ19 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCSAPQ6IQ19 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCSAPQ6IQ19 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCSAPQ6IQ19 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCSAPQ6IQ19 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCSAPQ6IQ19 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCSAPQ6IQ19 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCSAPQ6IQ19 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCSAPQ6IQ19 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCSAPQ6IQ19 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCSAPQ6IQ19 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCSAPQ6IQ19 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCSAPQ6IQ19 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCSAPQ6IQ19 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCSAPQ6IQ19 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCSAPQ6IQ19 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCSAPQ6IQ19 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCSAPQ6IQ19 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCSAPQ6IQ19 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCSAPQ6IQ19 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCSAPQ6IQ19 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCSAPQ6IQ19 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCSAPQ6IQ19 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCSAPQ6IQ19 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCSAPQ6IQ19 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCSAPQ6IQ19 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCSAPQ6IQ19 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCSAPQ6IQ19 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCSAPQ6IQ19 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCSAPQ6IQ19 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCSAPQ6IQ19 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCSAPQ6IQ19 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCSAPQ6IQ19 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCSAPQ6IQ19 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCSAPQ6IQ19 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCSAPQ6IQ19 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCSAPQ6IQ19 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCSAPQ6IQ19 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCSAPQ6IQ19 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCSAPQ6IQ19 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCSAPQ6IQ19 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCSAPQ6IQ19 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CCSAPQ6IQ19 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCSAPQ6IQ19 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCSAPQ6IQ19 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CCSAPQ6IQ19 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCSAPQ6IQ19 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCSAPQ6IQ19 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCSAPQ6IQ19 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCSAPQ6IQ19 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCSAPQ6IQ19 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCSAPQ6IQ19 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCSAPQ6IQ19 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCSAPQ6IQ19 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCSAPQ6IQ19 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCSAPQ6IQ19 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCSAPQ6IQ19 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCSAPQ6IQ19 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCSAPQ6IQ19 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCSAPQ6IQ19 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCSAPQ6IQ19 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCSAPQ6IQ19 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCSAPQ6IQ19 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCSAPQ6IQ19 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCSAPQ6IQ19 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCSAPQ6IQ19 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCSAPQ6IQ19 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCSAPQ6IQ19 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCSAPQ6IQ19 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCSAPQ6IQ19 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCSAPQ6IQ19 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCSAPQ6IQ19 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCSAPQ6IQ19 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCSAPQ6IQ19 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCSAPQ6IQ19 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCSAPQ6IQ19 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCSAPQ6IQ19 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCSAPQ6IQ19 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCSAPQ6IQ19 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCSAPQ6IQ19 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCSAPQ6IQ19 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCSAPQ6IQ19 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCSAPQ6IQ19 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCSAPQ6IQ19 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCSAPQ6IQ19 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms