Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms