Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ATL3Q6DD88 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATL3Q6DD88 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATL3Q6DD88 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ATL3Q6DD88 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ATL3Q6DD88 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ATL3Q6DD88 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATL3Q6DD88 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATL3Q6DD88 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATL3Q6DD88 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATL3Q6DD88 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ATL3Q6DD88 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATL3Q6DD88 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATL3Q6DD88 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATL3Q6DD88 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATL3Q6DD88 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATL3Q6DD88 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATL3Q6DD88 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATL3Q6DD88 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATL3Q6DD88 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATL3Q6DD88 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATL3Q6DD88 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATL3Q6DD88 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATL3Q6DD88 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATL3Q6DD88 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATL3Q6DD88 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATL3Q6DD88 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATL3Q6DD88 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATL3Q6DD88 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATL3Q6DD88 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ATL3Q6DD88 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATL3Q6DD88 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ATL3Q6DD88 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATL3Q6DD88 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATL3Q6DD88 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ATL3Q6DD88 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATL3Q6DD88 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATL3Q6DD88 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATL3Q6DD88 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATL3Q6DD88 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATL3Q6DD88 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATL3Q6DD88 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATL3Q6DD88 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATL3Q6DD88 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ATL3Q6DD88 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATL3Q6DD88 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATL3Q6DD88 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATL3Q6DD88 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATL3Q6DD88 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATL3Q6DD88 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ATL3Q6DD88 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms