Protein–RNA interactions for Protein: Q6BDI9

REP15, Rab15 effector protein, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REP15Q6BDI9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
REP15Q6BDI9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms