Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
C9orf84Q5VXU9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
C9orf84Q5VXU9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
C9orf84Q5VXU9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
C9orf84Q5VXU9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
C9orf84Q5VXU9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
C9orf84Q5VXU9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
C9orf84Q5VXU9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
C9orf84Q5VXU9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC35.49■■■■□ 3.27
C9orf84Q5VXU9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
C9orf84Q5VXU9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
C9orf84Q5VXU9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
C9orf84Q5VXU9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
C9orf84Q5VXU9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
C9orf84Q5VXU9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
C9orf84Q5VXU9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
C9orf84Q5VXU9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
C9orf84Q5VXU9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
C9orf84Q5VXU9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
C9orf84Q5VXU9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
C9orf84Q5VXU9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
C9orf84Q5VXU9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
C9orf84Q5VXU9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
C9orf84Q5VXU9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
C9orf84Q5VXU9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
C9orf84Q5VXU9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
C9orf84Q5VXU9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
C9orf84Q5VXU9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
C9orf84Q5VXU9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
C9orf84Q5VXU9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
C9orf84Q5VXU9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
C9orf84Q5VXU9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
C9orf84Q5VXU9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
C9orf84Q5VXU9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
C9orf84Q5VXU9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
C9orf84Q5VXU9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
C9orf84Q5VXU9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
C9orf84Q5VXU9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
C9orf84Q5VXU9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
C9orf84Q5VXU9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
C9orf84Q5VXU9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
C9orf84Q5VXU9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
C9orf84Q5VXU9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
C9orf84Q5VXU9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
C9orf84Q5VXU9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
C9orf84Q5VXU9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
C9orf84Q5VXU9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
C9orf84Q5VXU9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
C9orf84Q5VXU9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
C9orf84Q5VXU9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
C9orf84Q5VXU9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
C9orf84Q5VXU9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
C9orf84Q5VXU9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
C9orf84Q5VXU9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
C9orf84Q5VXU9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
C9orf84Q5VXU9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
C9orf84Q5VXU9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
C9orf84Q5VXU9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
C9orf84Q5VXU9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
C9orf84Q5VXU9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
C9orf84Q5VXU9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
C9orf84Q5VXU9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
C9orf84Q5VXU9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
C9orf84Q5VXU9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
C9orf84Q5VXU9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
C9orf84Q5VXU9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
C9orf84Q5VXU9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
C9orf84Q5VXU9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
C9orf84Q5VXU9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
C9orf84Q5VXU9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
C9orf84Q5VXU9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
C9orf84Q5VXU9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
C9orf84Q5VXU9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
C9orf84Q5VXU9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
C9orf84Q5VXU9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
C9orf84Q5VXU9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
C9orf84Q5VXU9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
C9orf84Q5VXU9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
C9orf84Q5VXU9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
C9orf84Q5VXU9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
C9orf84Q5VXU9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
C9orf84Q5VXU9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
C9orf84Q5VXU9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
C9orf84Q5VXU9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
C9orf84Q5VXU9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
C9orf84Q5VXU9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
C9orf84Q5VXU9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
C9orf84Q5VXU9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
C9orf84Q5VXU9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
C9orf84Q5VXU9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
C9orf84Q5VXU9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
C9orf84Q5VXU9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
C9orf84Q5VXU9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
C9orf84Q5VXU9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
C9orf84Q5VXU9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
C9orf84Q5VXU9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
C9orf84Q5VXU9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
C9orf84Q5VXU9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
C9orf84Q5VXU9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
C9orf84Q5VXU9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms