Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
WDR78Q5VTH9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
WDR78Q5VTH9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
WDR78Q5VTH9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
WDR78Q5VTH9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
WDR78Q5VTH9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
WDR78Q5VTH9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
WDR78Q5VTH9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
WDR78Q5VTH9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
WDR78Q5VTH9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
WDR78Q5VTH9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
WDR78Q5VTH9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
WDR78Q5VTH9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
WDR78Q5VTH9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
WDR78Q5VTH9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
WDR78Q5VTH9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
WDR78Q5VTH9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
WDR78Q5VTH9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
WDR78Q5VTH9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
WDR78Q5VTH9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
WDR78Q5VTH9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
WDR78Q5VTH9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
WDR78Q5VTH9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
WDR78Q5VTH9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
WDR78Q5VTH9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
WDR78Q5VTH9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
WDR78Q5VTH9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
WDR78Q5VTH9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
WDR78Q5VTH9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
WDR78Q5VTH9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
WDR78Q5VTH9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
WDR78Q5VTH9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
WDR78Q5VTH9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
WDR78Q5VTH9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
WDR78Q5VTH9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
WDR78Q5VTH9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
WDR78Q5VTH9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
WDR78Q5VTH9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
WDR78Q5VTH9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
WDR78Q5VTH9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
WDR78Q5VTH9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms