Protein–RNA interactions for Protein: Q5VIR6

VPS53, Vacuolar protein sorting-associated protein 53 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS53Q5VIR6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VPS53Q5VIR6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
VPS53Q5VIR6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VPS53Q5VIR6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
VPS53Q5VIR6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VPS53Q5VIR6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS53Q5VIR6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS53Q5VIR6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS53Q5VIR6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS53Q5VIR6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS53Q5VIR6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS53Q5VIR6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS53Q5VIR6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS53Q5VIR6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS53Q5VIR6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS53Q5VIR6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS53Q5VIR6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS53Q5VIR6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS53Q5VIR6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VPS53Q5VIR6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VPS53Q5VIR6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
VPS53Q5VIR6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VPS53Q5VIR6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
VPS53Q5VIR6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VPS53Q5VIR6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VPS53Q5VIR6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VPS53Q5VIR6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VPS53Q5VIR6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VPS53Q5VIR6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VPS53Q5VIR6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VPS53Q5VIR6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VPS53Q5VIR6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VPS53Q5VIR6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
VPS53Q5VIR6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VPS53Q5VIR6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
VPS53Q5VIR6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VPS53Q5VIR6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
VPS53Q5VIR6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
VPS53Q5VIR6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VPS53Q5VIR6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
VPS53Q5VIR6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VPS53Q5VIR6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VPS53Q5VIR6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VPS53Q5VIR6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VPS53Q5VIR6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VPS53Q5VIR6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VPS53Q5VIR6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VPS53Q5VIR6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VPS53Q5VIR6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VPS53Q5VIR6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VPS53Q5VIR6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VPS53Q5VIR6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VPS53Q5VIR6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VPS53Q5VIR6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VPS53Q5VIR6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VPS53Q5VIR6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS53Q5VIR6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS53Q5VIR6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS53Q5VIR6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS53Q5VIR6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS53Q5VIR6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS53Q5VIR6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS53Q5VIR6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS53Q5VIR6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VPS53Q5VIR6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VPS53Q5VIR6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VPS53Q5VIR6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VPS53Q5VIR6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VPS53Q5VIR6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VPS53Q5VIR6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VPS53Q5VIR6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS53Q5VIR6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS53Q5VIR6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS53Q5VIR6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS53Q5VIR6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS53Q5VIR6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VPS53Q5VIR6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
VPS53Q5VIR6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VPS53Q5VIR6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VPS53Q5VIR6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VPS53Q5VIR6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VPS53Q5VIR6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VPS53Q5VIR6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VPS53Q5VIR6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
VPS53Q5VIR6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VPS53Q5VIR6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VPS53Q5VIR6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VPS53Q5VIR6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VPS53Q5VIR6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VPS53Q5VIR6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
VPS53Q5VIR6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VPS53Q5VIR6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS53Q5VIR6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS53Q5VIR6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS53Q5VIR6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS53Q5VIR6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS53Q5VIR6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS53Q5VIR6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS53Q5VIR6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS53Q5VIR6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms