Protein–RNA interactions for Protein: Q5TG30

ARHGAP40, Rho GTPase-activating protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP40Q5TG30 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGAP40Q5TG30 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGAP40Q5TG30 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGAP40Q5TG30 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGAP40Q5TG30 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP40Q5TG30 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP40Q5TG30 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP40Q5TG30 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP40Q5TG30 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP40Q5TG30 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP40Q5TG30 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP40Q5TG30 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP40Q5TG30 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP40Q5TG30 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGAP40Q5TG30 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGAP40Q5TG30 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGAP40Q5TG30 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGAP40Q5TG30 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGAP40Q5TG30 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGAP40Q5TG30 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGAP40Q5TG30 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGAP40Q5TG30 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGAP40Q5TG30 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGAP40Q5TG30 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP40Q5TG30 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGAP40Q5TG30 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGAP40Q5TG30 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGAP40Q5TG30 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGAP40Q5TG30 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGAP40Q5TG30 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGAP40Q5TG30 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP40Q5TG30 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP40Q5TG30 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP40Q5TG30 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP40Q5TG30 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP40Q5TG30 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP40Q5TG30 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP40Q5TG30 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP40Q5TG30 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP40Q5TG30 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP40Q5TG30 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP40Q5TG30 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP40Q5TG30 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP40Q5TG30 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP40Q5TG30 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.9 ms