Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF628Q5EBL2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF628Q5EBL2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF628Q5EBL2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF628Q5EBL2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF628Q5EBL2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF628Q5EBL2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF628Q5EBL2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF628Q5EBL2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF628Q5EBL2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF628Q5EBL2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF628Q5EBL2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF628Q5EBL2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF628Q5EBL2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF628Q5EBL2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF628Q5EBL2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF628Q5EBL2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF628Q5EBL2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF628Q5EBL2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF628Q5EBL2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF628Q5EBL2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF628Q5EBL2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF628Q5EBL2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF628Q5EBL2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF628Q5EBL2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF628Q5EBL2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF628Q5EBL2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF628Q5EBL2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF628Q5EBL2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF628Q5EBL2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZNF628Q5EBL2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZNF628Q5EBL2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF628Q5EBL2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF628Q5EBL2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF628Q5EBL2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF628Q5EBL2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF628Q5EBL2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF628Q5EBL2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF628Q5EBL2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF628Q5EBL2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF628Q5EBL2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF628Q5EBL2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF628Q5EBL2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF628Q5EBL2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF628Q5EBL2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF628Q5EBL2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF628Q5EBL2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF628Q5EBL2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF628Q5EBL2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF628Q5EBL2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF628Q5EBL2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF628Q5EBL2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF628Q5EBL2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF628Q5EBL2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF628Q5EBL2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF628Q5EBL2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF628Q5EBL2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF628Q5EBL2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF628Q5EBL2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF628Q5EBL2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF628Q5EBL2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF628Q5EBL2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF628Q5EBL2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF628Q5EBL2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF628Q5EBL2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF628Q5EBL2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF628Q5EBL2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF628Q5EBL2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF628Q5EBL2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF628Q5EBL2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF628Q5EBL2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF628Q5EBL2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF628Q5EBL2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF628Q5EBL2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF628Q5EBL2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF628Q5EBL2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF628Q5EBL2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF628Q5EBL2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF628Q5EBL2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF628Q5EBL2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF628Q5EBL2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF628Q5EBL2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF628Q5EBL2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF628Q5EBL2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF628Q5EBL2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF628Q5EBL2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF628Q5EBL2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF628Q5EBL2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF628Q5EBL2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF628Q5EBL2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF628Q5EBL2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF628Q5EBL2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF628Q5EBL2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF628Q5EBL2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF628Q5EBL2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF628Q5EBL2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF628Q5EBL2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF628Q5EBL2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF628Q5EBL2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF628Q5EBL2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms