Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ODF2Q5BJF6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ODF2Q5BJF6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ODF2Q5BJF6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ODF2Q5BJF6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ODF2Q5BJF6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ODF2Q5BJF6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ODF2Q5BJF6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ODF2Q5BJF6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ODF2Q5BJF6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ODF2Q5BJF6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ODF2Q5BJF6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ODF2Q5BJF6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ODF2Q5BJF6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ODF2Q5BJF6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ODF2Q5BJF6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ODF2Q5BJF6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ODF2Q5BJF6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ODF2Q5BJF6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ODF2Q5BJF6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ODF2Q5BJF6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ODF2Q5BJF6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ODF2Q5BJF6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ODF2Q5BJF6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ODF2Q5BJF6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ODF2Q5BJF6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ODF2Q5BJF6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ODF2Q5BJF6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ODF2Q5BJF6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ODF2Q5BJF6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ODF2Q5BJF6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ODF2Q5BJF6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ODF2Q5BJF6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ODF2Q5BJF6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ODF2Q5BJF6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ODF2Q5BJF6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ODF2Q5BJF6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ODF2Q5BJF6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ODF2Q5BJF6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ODF2Q5BJF6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ODF2Q5BJF6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ODF2Q5BJF6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ODF2Q5BJF6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms