Protein–RNA interactions for Protein: Q52LA3

LIN52, Protein lin-52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN52Q52LA3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms