Protein–RNA interactions for Protein: Q4KN68

LINC01620, Uncharacterized protein encoded by LINC01620, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01620Q4KN68 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC01620Q4KN68 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms