Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LONRF3Q496Y0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LONRF3Q496Y0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LONRF3Q496Y0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LONRF3Q496Y0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LONRF3Q496Y0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LONRF3Q496Y0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LONRF3Q496Y0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LONRF3Q496Y0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LONRF3Q496Y0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LONRF3Q496Y0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LONRF3Q496Y0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LONRF3Q496Y0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LONRF3Q496Y0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LONRF3Q496Y0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LONRF3Q496Y0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LONRF3Q496Y0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LONRF3Q496Y0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LONRF3Q496Y0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LONRF3Q496Y0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LONRF3Q496Y0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LONRF3Q496Y0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LONRF3Q496Y0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LONRF3Q496Y0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LONRF3Q496Y0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LONRF3Q496Y0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LONRF3Q496Y0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LONRF3Q496Y0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LONRF3Q496Y0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LONRF3Q496Y0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LONRF3Q496Y0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LONRF3Q496Y0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LONRF3Q496Y0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LONRF3Q496Y0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LONRF3Q496Y0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LONRF3Q496Y0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LONRF3Q496Y0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LONRF3Q496Y0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LONRF3Q496Y0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LONRF3Q496Y0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LONRF3Q496Y0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LONRF3Q496Y0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LONRF3Q496Y0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LONRF3Q496Y0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LONRF3Q496Y0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LONRF3Q496Y0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LONRF3Q496Y0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LONRF3Q496Y0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LONRF3Q496Y0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LONRF3Q496Y0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LONRF3Q496Y0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LONRF3Q496Y0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LONRF3Q496Y0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms