Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRNP35Q16560 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRNP35Q16560 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRNP35Q16560 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRNP35Q16560 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRNP35Q16560 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRNP35Q16560 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRNP35Q16560 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRNP35Q16560 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRNP35Q16560 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRNP35Q16560 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRNP35Q16560 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRNP35Q16560 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRNP35Q16560 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRNP35Q16560 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRNP35Q16560 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRNP35Q16560 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRNP35Q16560 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRNP35Q16560 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRNP35Q16560 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRNP35Q16560 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRNP35Q16560 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRNP35Q16560 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRNP35Q16560 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRNP35Q16560 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRNP35Q16560 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRNP35Q16560 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRNP35Q16560 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRNP35Q16560 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRNP35Q16560 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRNP35Q16560 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRNP35Q16560 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRNP35Q16560 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRNP35Q16560 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRNP35Q16560 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRNP35Q16560 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNRNP35Q16560 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SNRNP35Q16560 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNRNP35Q16560 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNRNP35Q16560 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNRNP35Q16560 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNRNP35Q16560 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNRNP35Q16560 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNRNP35Q16560 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNRNP35Q16560 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNRNP35Q16560 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNRNP35Q16560 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNRNP35Q16560 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNRNP35Q16560 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNRNP35Q16560 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNRNP35Q16560 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNRNP35Q16560 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNRNP35Q16560 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNRNP35Q16560 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SNRNP35Q16560 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNRNP35Q16560 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRNP35Q16560 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRNP35Q16560 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRNP35Q16560 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRNP35Q16560 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRNP35Q16560 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRNP35Q16560 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRNP35Q16560 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRNP35Q16560 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRNP35Q16560 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
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