Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDSNQ15517 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDSNQ15517 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDSNQ15517 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDSNQ15517 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDSNQ15517 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDSNQ15517 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDSNQ15517 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDSNQ15517 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDSNQ15517 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDSNQ15517 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CDSNQ15517 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CDSNQ15517 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDSNQ15517 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDSNQ15517 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDSNQ15517 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDSNQ15517 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDSNQ15517 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDSNQ15517 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDSNQ15517 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDSNQ15517 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDSNQ15517 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDSNQ15517 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDSNQ15517 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDSNQ15517 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CDSNQ15517 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDSNQ15517 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDSNQ15517 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDSNQ15517 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDSNQ15517 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDSNQ15517 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDSNQ15517 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDSNQ15517 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CDSNQ15517 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDSNQ15517 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDSNQ15517 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDSNQ15517 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CDSNQ15517 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDSNQ15517 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDSNQ15517 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDSNQ15517 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDSNQ15517 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDSNQ15517 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDSNQ15517 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDSNQ15517 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDSNQ15517 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDSNQ15517 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDSNQ15517 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDSNQ15517 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDSNQ15517 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDSNQ15517 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDSNQ15517 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDSNQ15517 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDSNQ15517 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDSNQ15517 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDSNQ15517 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDSNQ15517 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDSNQ15517 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDSNQ15517 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDSNQ15517 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CDSNQ15517 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDSNQ15517 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CDSNQ15517 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CDSNQ15517 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDSNQ15517 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDSNQ15517 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDSNQ15517 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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