Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CNGB1Q14028 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CNGB1Q14028 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CNGB1Q14028 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CNGB1Q14028 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CNGB1Q14028 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CNGB1Q14028 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CNGB1Q14028 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CNGB1Q14028 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CNGB1Q14028 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CNGB1Q14028 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CNGB1Q14028 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CNGB1Q14028 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CNGB1Q14028 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
CNGB1Q14028 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CNGB1Q14028 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CNGB1Q14028 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
CNGB1Q14028 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
CNGB1Q14028 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
CNGB1Q14028 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CNGB1Q14028 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CNGB1Q14028 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CNGB1Q14028 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CNGB1Q14028 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CNGB1Q14028 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
CNGB1Q14028 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CNGB1Q14028 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CNGB1Q14028 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CNGB1Q14028 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CNGB1Q14028 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CNGB1Q14028 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CNGB1Q14028 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CNGB1Q14028 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CNGB1Q14028 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CNGB1Q14028 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CNGB1Q14028 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CNGB1Q14028 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
CNGB1Q14028 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CNGB1Q14028 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CNGB1Q14028 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
CNGB1Q14028 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CNGB1Q14028 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CNGB1Q14028 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CNGB1Q14028 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CNGB1Q14028 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CNGB1Q14028 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CNGB1Q14028 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CNGB1Q14028 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CNGB1Q14028 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.69
CNGB1Q14028 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CNGB1Q14028 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CNGB1Q14028 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
CNGB1Q14028 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CNGB1Q14028 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CNGB1Q14028 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CNGB1Q14028 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CNGB1Q14028 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
CNGB1Q14028 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CNGB1Q14028 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CNGB1Q14028 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CNGB1Q14028 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CNGB1Q14028 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CNGB1Q14028 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
CNGB1Q14028 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CNGB1Q14028 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CNGB1Q14028 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CNGB1Q14028 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CNGB1Q14028 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CNGB1Q14028 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CNGB1Q14028 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CNGB1Q14028 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CNGB1Q14028 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CNGB1Q14028 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CNGB1Q14028 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CNGB1Q14028 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CNGB1Q14028 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CNGB1Q14028 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CNGB1Q14028 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
CNGB1Q14028 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CNGB1Q14028 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CNGB1Q14028 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CNGB1Q14028 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CNGB1Q14028 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CNGB1Q14028 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CNGB1Q14028 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CNGB1Q14028 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CNGB1Q14028 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CNGB1Q14028 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
CNGB1Q14028 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CNGB1Q14028 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CNGB1Q14028 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CNGB1Q14028 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
CNGB1Q14028 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CNGB1Q14028 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
CNGB1Q14028 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
CNGB1Q14028 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CNGB1Q14028 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CNGB1Q14028 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CNGB1Q14028 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CNGB1Q14028 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
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