Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKAP5Q14008 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKAP5Q14008 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKAP5Q14008 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CKAP5Q14008 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKAP5Q14008 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKAP5Q14008 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKAP5Q14008 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKAP5Q14008 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKAP5Q14008 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKAP5Q14008 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKAP5Q14008 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKAP5Q14008 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKAP5Q14008 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKAP5Q14008 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CKAP5Q14008 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKAP5Q14008 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKAP5Q14008 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKAP5Q14008 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKAP5Q14008 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKAP5Q14008 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKAP5Q14008 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CKAP5Q14008 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CKAP5Q14008 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CKAP5Q14008 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CKAP5Q14008 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CKAP5Q14008 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CKAP5Q14008 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CKAP5Q14008 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CKAP5Q14008 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKAP5Q14008 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKAP5Q14008 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKAP5Q14008 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKAP5Q14008 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKAP5Q14008 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKAP5Q14008 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CKAP5Q14008 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CKAP5Q14008 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CKAP5Q14008 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CKAP5Q14008 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CKAP5Q14008 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CKAP5Q14008 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CKAP5Q14008 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CKAP5Q14008 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CKAP5Q14008 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CKAP5Q14008 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CKAP5Q14008 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKAP5Q14008 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
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