Protein–RNA interactions for Protein: Q13952

NFYC, Nuclear transcription factor Y subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFYCQ13952 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFYCQ13952 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFYCQ13952 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFYCQ13952 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFYCQ13952 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFYCQ13952 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFYCQ13952 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFYCQ13952 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFYCQ13952 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFYCQ13952 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFYCQ13952 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFYCQ13952 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFYCQ13952 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFYCQ13952 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFYCQ13952 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFYCQ13952 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFYCQ13952 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFYCQ13952 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFYCQ13952 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFYCQ13952 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFYCQ13952 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFYCQ13952 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFYCQ13952 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFYCQ13952 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFYCQ13952 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFYCQ13952 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFYCQ13952 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFYCQ13952 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFYCQ13952 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFYCQ13952 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFYCQ13952 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFYCQ13952 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFYCQ13952 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFYCQ13952 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFYCQ13952 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFYCQ13952 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFYCQ13952 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFYCQ13952 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFYCQ13952 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms