Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA9Q13797 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA9Q13797 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA9Q13797 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA9Q13797 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA9Q13797 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA9Q13797 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA9Q13797 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA9Q13797 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA9Q13797 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA9Q13797 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA9Q13797 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA9Q13797 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA9Q13797 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA9Q13797 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA9Q13797 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA9Q13797 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA9Q13797 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA9Q13797 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA9Q13797 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA9Q13797 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA9Q13797 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA9Q13797 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA9Q13797 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA9Q13797 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA9Q13797 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA9Q13797 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA9Q13797 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA9Q13797 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA9Q13797 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA9Q13797 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA9Q13797 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA9Q13797 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA9Q13797 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA9Q13797 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA9Q13797 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA9Q13797 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA9Q13797 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA9Q13797 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA9Q13797 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA9Q13797 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA9Q13797 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
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