Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALCAMQ13740 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALCAMQ13740 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALCAMQ13740 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALCAMQ13740 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALCAMQ13740 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALCAMQ13740 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALCAMQ13740 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ALCAMQ13740 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALCAMQ13740 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALCAMQ13740 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ALCAMQ13740 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALCAMQ13740 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALCAMQ13740 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALCAMQ13740 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALCAMQ13740 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALCAMQ13740 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALCAMQ13740 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALCAMQ13740 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALCAMQ13740 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALCAMQ13740 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALCAMQ13740 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ALCAMQ13740 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALCAMQ13740 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALCAMQ13740 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALCAMQ13740 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALCAMQ13740 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALCAMQ13740 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALCAMQ13740 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALCAMQ13740 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALCAMQ13740 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALCAMQ13740 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALCAMQ13740 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALCAMQ13740 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALCAMQ13740 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ALCAMQ13740 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALCAMQ13740 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALCAMQ13740 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALCAMQ13740 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALCAMQ13740 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALCAMQ13740 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALCAMQ13740 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALCAMQ13740 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALCAMQ13740 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ALCAMQ13740 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALCAMQ13740 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALCAMQ13740 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALCAMQ13740 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALCAMQ13740 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ALCAMQ13740 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALCAMQ13740 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALCAMQ13740 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALCAMQ13740 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALCAMQ13740 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALCAMQ13740 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALCAMQ13740 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALCAMQ13740 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALCAMQ13740 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALCAMQ13740 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALCAMQ13740 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALCAMQ13740 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ALCAMQ13740 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALCAMQ13740 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALCAMQ13740 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALCAMQ13740 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALCAMQ13740 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALCAMQ13740 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALCAMQ13740 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALCAMQ13740 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ALCAMQ13740 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALCAMQ13740 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALCAMQ13740 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALCAMQ13740 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALCAMQ13740 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALCAMQ13740 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALCAMQ13740 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALCAMQ13740 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALCAMQ13740 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALCAMQ13740 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALCAMQ13740 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALCAMQ13740 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALCAMQ13740 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALCAMQ13740 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALCAMQ13740 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALCAMQ13740 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALCAMQ13740 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALCAMQ13740 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALCAMQ13740 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALCAMQ13740 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALCAMQ13740 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALCAMQ13740 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALCAMQ13740 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALCAMQ13740 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALCAMQ13740 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALCAMQ13740 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALCAMQ13740 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALCAMQ13740 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALCAMQ13740 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ALCAMQ13740 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
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