Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATP1A4Q13733 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms