Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PMS2P11Q13670 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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