Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CUL4BQ13620 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CUL4BQ13620 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CUL4BQ13620 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CUL4BQ13620 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CUL4BQ13620 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CUL4BQ13620 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CUL4BQ13620 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CUL4BQ13620 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CUL4BQ13620 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CUL4BQ13620 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CUL4BQ13620 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CUL4BQ13620 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CUL4BQ13620 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CUL4BQ13620 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CUL4BQ13620 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CUL4BQ13620 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CUL4BQ13620 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CUL4BQ13620 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CUL4BQ13620 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CUL4BQ13620 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CUL4BQ13620 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CUL4BQ13620 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CUL4BQ13620 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CUL4BQ13620 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CUL4BQ13620 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CUL4BQ13620 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CUL4BQ13620 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CUL4BQ13620 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CUL4BQ13620 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CUL4BQ13620 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CUL4BQ13620 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CUL4BQ13620 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CUL4BQ13620 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CUL4BQ13620 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CUL4BQ13620 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CUL4BQ13620 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CUL4BQ13620 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
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