Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAE1Q13564 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAE1Q13564 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAE1Q13564 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAE1Q13564 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAE1Q13564 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAE1Q13564 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAE1Q13564 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAE1Q13564 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAE1Q13564 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAE1Q13564 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAE1Q13564 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAE1Q13564 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NAE1Q13564 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NAE1Q13564 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NAE1Q13564 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NAE1Q13564 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NAE1Q13564 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NAE1Q13564 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NAE1Q13564 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NAE1Q13564 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NAE1Q13564 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NAE1Q13564 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NAE1Q13564 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NAE1Q13564 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NAE1Q13564 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NAE1Q13564 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NAE1Q13564 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAE1Q13564 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAE1Q13564 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAE1Q13564 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAE1Q13564 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAE1Q13564 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAE1Q13564 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAE1Q13564 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAE1Q13564 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NAE1Q13564 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NAE1Q13564 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NAE1Q13564 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NAE1Q13564 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NAE1Q13564 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NAE1Q13564 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NAE1Q13564 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NAE1Q13564 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NAE1Q13564 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NAE1Q13564 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NAE1Q13564 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NAE1Q13564 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NAE1Q13564 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NAE1Q13564 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms