Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

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Length 666 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAMK2BQ13554 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAMK2BQ13554 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CAMK2BQ13554 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAMK2BQ13554 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAMK2BQ13554 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAMK2BQ13554 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CAMK2BQ13554 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAMK2BQ13554 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAMK2BQ13554 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAMK2BQ13554 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAMK2BQ13554 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAMK2BQ13554 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAMK2BQ13554 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAMK2BQ13554 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAMK2BQ13554 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CAMK2BQ13554 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAMK2BQ13554 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAMK2BQ13554 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAMK2BQ13554 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMK2BQ13554 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMK2BQ13554 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMK2BQ13554 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMK2BQ13554 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMK2BQ13554 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMK2BQ13554 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMK2BQ13554 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMK2BQ13554 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMK2BQ13554 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMK2BQ13554 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMK2BQ13554 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMK2BQ13554 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMK2BQ13554 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMK2BQ13554 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMK2BQ13554 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMK2BQ13554 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMK2BQ13554 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMK2BQ13554 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMK2BQ13554 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMK2BQ13554 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMK2BQ13554 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMK2BQ13554 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMK2BQ13554 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAMK2BQ13554 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAMK2BQ13554 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAMK2BQ13554 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAMK2BQ13554 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAMK2BQ13554 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
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