Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRPL49Q13405 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRPL49Q13405 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRPL49Q13405 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRPL49Q13405 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRPL49Q13405 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRPL49Q13405 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRPL49Q13405 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRPL49Q13405 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRPL49Q13405 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRPL49Q13405 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRPL49Q13405 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRPL49Q13405 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRPL49Q13405 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRPL49Q13405 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRPL49Q13405 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRPL49Q13405 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRPL49Q13405 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRPL49Q13405 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRPL49Q13405 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRPL49Q13405 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MRPL49Q13405 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRPL49Q13405 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRPL49Q13405 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRPL49Q13405 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRPL49Q13405 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRPL49Q13405 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRPL49Q13405 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRPL49Q13405 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRPL49Q13405 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRPL49Q13405 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRPL49Q13405 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
MRPL49Q13405 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
MRPL49Q13405 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
MRPL49Q13405 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRPL49Q13405 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRPL49Q13405 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRPL49Q13405 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRPL49Q13405 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRPL49Q13405 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MRPL49Q13405 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MRPL49Q13405 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MRPL49Q13405 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MRPL49Q13405 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MRPL49Q13405 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MRPL49Q13405 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MRPL49Q13405 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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