Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYCNQ0VAF6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms