Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DSC1Q08554 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DSC1Q08554 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DSC1Q08554 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DSC1Q08554 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DSC1Q08554 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DSC1Q08554 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DSC1Q08554 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DSC1Q08554 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DSC1Q08554 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DSC1Q08554 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DSC1Q08554 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
DSC1Q08554 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DSC1Q08554 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DSC1Q08554 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DSC1Q08554 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DSC1Q08554 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DSC1Q08554 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DSC1Q08554 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DSC1Q08554 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DSC1Q08554 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DSC1Q08554 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DSC1Q08554 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DSC1Q08554 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DSC1Q08554 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DSC1Q08554 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DSC1Q08554 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DSC1Q08554 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DSC1Q08554 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DSC1Q08554 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DSC1Q08554 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DSC1Q08554 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DSC1Q08554 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DSC1Q08554 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DSC1Q08554 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DSC1Q08554 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DSC1Q08554 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DSC1Q08554 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DSC1Q08554 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DSC1Q08554 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DSC1Q08554 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DSC1Q08554 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DSC1Q08554 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DSC1Q08554 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DSC1Q08554 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DSC1Q08554 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DSC1Q08554 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DSC1Q08554 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DSC1Q08554 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DSC1Q08554 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
DSC1Q08554 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DSC1Q08554 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DSC1Q08554 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DSC1Q08554 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DSC1Q08554 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DSC1Q08554 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DSC1Q08554 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DSC1Q08554 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DSC1Q08554 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DSC1Q08554 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DSC1Q08554 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DSC1Q08554 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DSC1Q08554 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DSC1Q08554 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
DSC1Q08554 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DSC1Q08554 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DSC1Q08554 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DSC1Q08554 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DSC1Q08554 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DSC1Q08554 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DSC1Q08554 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DSC1Q08554 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DSC1Q08554 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DSC1Q08554 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DSC1Q08554 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DSC1Q08554 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DSC1Q08554 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DSC1Q08554 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DSC1Q08554 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DSC1Q08554 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
DSC1Q08554 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
DSC1Q08554 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DSC1Q08554 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DSC1Q08554 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DSC1Q08554 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DSC1Q08554 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DSC1Q08554 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DSC1Q08554 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DSC1Q08554 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DSC1Q08554 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DSC1Q08554 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DSC1Q08554 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DSC1Q08554 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DSC1Q08554 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DSC1Q08554 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DSC1Q08554 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DSC1Q08554 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DSC1Q08554 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DSC1Q08554 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DSC1Q08554 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms